Käpt’n Barnius, Professor Tintling und der Arzt Peso Pinguin leben gemeinsam mit ihren fünf Teamkollegen in einer Forschungsstation. Von dort aus erkunden sie den Ozean und retten Meeresbewohner, die sich in Gefahr befinden. Die Oktonauten erforschen auch das Verhalten der Tiere. Bei ihren Expeditionen begegnen ihnen viele außergewöhnliche Geschöpfe.